Профилирование QTL позволяет селекционерам точно определить, какие гены и признаки присутствуют или отсутствуют в их селекционном материале. Этот новый инструмент, разработанный благодаря техническому опыту учёного IRRI доктора Дэмиена Платтена, сокращает недели работы до минут, быстро определяя такие признаки, как устойчивость к болезням, засухоустойчивость или качество зерна в геноме растения. Это, в свою очередь, помогает ускорить разработку сортов риса, способных удовлетворить растущий спрос и адаптироваться к последствиям изменения климата.
Традиционно анализ молекулярных данных был медленной и кропотливой задачей, которая часто занимала дни, а то и недели, включая очистку наборов данных и интерпретацию результатов. Благодаря новому инструменту, встроенному в модуль анализа молекулярных данных (MDA) на платформе EBS, процесс упрощается до трёх этапов: запрос, загрузка и анализ. За считанные минуты селекционеры получают точные профили QTL, что позволяет им сосредоточиться на принятии стратегических решений в селекции.
Для риса, где IRRI лидирует в мировой селекции, инструмент генерирует профили QTL примерно для 90 высокоценных генов, контролирующих признаки, наиболее востребованные фермерами и потребителями. Он даёт селекционерам «мгновенную картину» того, несут ли их линии критически важные признаки, обеспечивающие устойчивость риса к изменению климата, что упрощает им выбор сортов для сохранения, скрещивания или выпуска в производство, и, следовательно, сокращает время, необходимое для выращивания улучшенных семян.
Обновление также поддерживает проверку качества семян, подтверждение происхождения и анализ признаков риса и других культур. Функция QTL-профилирования очищает данные ДНК, идентифицирует ключевые маркеры, сравнивает гены разных сортов и представляет визуализированные результаты, что упрощает выбор лучших сортов для селекции.
«Эта новая возможность EBS для обработки генетической информации и данных ДНК знаменует собой важную веху в нашей миссии по упрощению работы селекционеров, одновременно предоставляя им возможность оказывать большее влияние на фермеров», — сказал Андре Моретто Эмберсикс, руководитель отдела цифровых решений по селекционным ресурсам CGIAR.
«Это достижение стало возможным только благодаря самоотверженности команды BR Digital Solutions и прочным партнёрским отношениям, которые мы выстроили с центрами CGIAR, такими как IRRI. Команда IRRI Rice была нашим надёжным партнёром ещё до того, как EBS появился на рынке, и сотрудничество с ними продолжает приносить значимые результаты», — добавил он.
О платформе EBS
Система селекционной работы (EBS) – это глобальная цифровая платформа CGIAR, разработанная для поддержки современной селекции растений. Благодаря интеграции инструментов управления данными, аналитики и поддержки принятия решений, EBS позволяет селекционерам по всему миру эффективнее и продуктивнее создавать улучшенные, устойчивые к изменению климата и востребованные рынком сорта сельскохозяйственных культур. Рис, пшеница и кукуруза стали одними из первых, где внедрили EBS, и теперь платформа поддерживает 20 культур в центрах CGIAR и NARES.
Это обновление также вносит вклад в работу IRRI в рамках научной программы CGIAR «Селекция для будущего» (B4T) в рамках направления «Инклюзивная поставка». Программа направлена на повышение производительности, более широкое внедрение сортов и поддержку более устойчивых и ориентированных на фермеров продовольственных систем путем внедрения рыночной аналитики в селекционные процессы в Африке и Азии.
Источник: IRRI.
