Произвольные названия вирусов целесообразно сопровождать криптограммами. Основными разработчиками таких зашифрованных сведений о вирусе считают А. Гибса и В. Харисона.В частности, криптограмма вируса табачной мозаики (ВТМ) имеет вид R/1:2/5:E/E:S/O. Все четыре пары символов криптограммы вируса несут определенную информацию.

Первая пара

Первая пара символов, применительно к вирусу табачной мозаики – это R/1, указывает на тип нуклеиновой кислоты (R– это РНК, D– ДНК) и число нитей в молекуле (1 – однонитевая, 2 – двухнитевая).

Вторая пара

Вторая пара символов, применительно к вирусу табачной мозаики – это 2/5, обозначает молекулярную массу нуклеиновой кислоты (в миллионах дальтон) и ее содержание в инфекционных единицах (в процентах).

Запись второй пары символов криптограммы вируса табачной мозаики демонстрирует, что молекулярная масса рибонуклеиновой кислоты (РНК) вириона данного вируса составляет два миллиона дальтон, а содержание нуклеиновой кислоты в вирионе – 2%. Если вирус имеет фрагментированный геном, то это так же находит отражение в криптограмме. Если разные фрагменты генома входят в состав однородных частиц, то первый символ второй пары символов обозначает общую молекулярную массу всех фрагментов. Примером может служить криптограмма вируса раневых опухолей клевера – R/2:16/22:S/S: S/Au.

Расположение фрагментов генома в частицах разного типа описывается отдельно состав частиц каждого типа. Примером служит криптограмма вируса погремковости табака – R/1:23/5 +0,6/5+1,3/5;E/E: S/Ne.

Третья пара

Третья пара символов, применительно к вирусу табачной мозаики – это E/E, характеризует форму вириона и форму капсида.

Для обозначения формы вириона и капсида принято использовать следующие символы:

  • S– сферическая или близкая к сферической форма;
  • E– удлиненная структура с параллельными сторонами и незакругленными концами;
  • U– удлиненная форма с параллельными сторонами и закругленным одним или обоими концами;
  • X– сложная или отличная от выше перечисленных форма.

В частности, согласно криптограмме, у вируса табачной мозаики вирион и капсид удлиненной структуры с параллельными сторонами и незакругленными концами (E/E).

Четвертая пара

Четвертая пара символов, применительно к вирусу табачной мозаики – это S/O. Она обозначает тип заражаемого хозяина и тип переносчика. Для обозначения типа инфицируемого организма (хозяина) применяют следующие символы:

  • A– водоросли (alga);
  • B– бактерии (bacterium);
  • F– грибы (fungus);
  • I– беспозвоночные (invertebrate);
  • M– микоплазма (mycoplasma);
  • P– папоротникообразные растения (pteridophyte);
  • S– семенные растения (seedplans);
  • V – позвоночные (vertebrate).

Обозначения типа переносчика применяют следующие символы:

  • Ac – клещи (Acarina, Arachnida);
  • Al – белокрылки (Aleyrodidae, Homoptera, Insecta);
  • Ap – тли (Aphididae, Homoptera, Insecta);
  • Au – цикадки(Cicadellidae,Insecta);
  • Cc – червецы (кокциды) (Coccodea, Homoptera, Insecta);
  • Cl – жуки (Coleoptera, Insecta);
  • Di – мухи, комары (Diptera,Insecta);
  • Fu – грибы (Fungu);
  • Gy – клопы (Gymnocerata, Hemiptera)
  • Ne – нематоды (Nematodes)
  • Ps – псиллиды (листоблошки) (Psyllidae, Homoptera)
  • Si – блохи (Siphonaptera, Insecta);
  • Th– трипсы (Thysanoptera, Insecta);
  • Ve– переносчик известен, но не принадлежит ни к одному из указанных выше типов;
  • O– вирус распространяется без переносчика, то есть заражение осуществляется вирусом, находящимся в окружающей среде.

Таким образом, по отношению к вирусу табачной мозаики, четвертая пара символов

(S/O) расшифровывается следующим образом: заражаемые организмы-хозяева – семенные растения, вирус распространяется без переносчика. Четвертая пара символов криптограммы ВТМ может выглядеть – S/*. В этом случае хозяин – тот же, но переносчик неизвестен.

Символы, используемые во всех парах

Свойства вирусов изучены недостаточно. Для обозначения неизвестных или не подтвержденных данных о свойствах и структуре вирионов во всех четырех парах принято использовать обозначения:

  • * – информация о свойстве или структуре вируса отсутствует;
  • ( ) – указанные в скобках данные не подтверждены или не точны;
  • [ ] – криптограмма или сведения внутри квадратных скобок характеризуют вирусную группу в целом.

(c) Справочник AgroXXI