Бактериальные и вирусные инфекции крайне опасны для рыбоводных хозяйств, вызывая массовую гибель поголовья. Ученые Санкт-Петербургского государственного аграрного университета разработали новаторскую тест-систему, позволяющую одновременно выявлять от шести до восьми основных патогенов, а результаты анализа предоставляются менее чем за два часа.
Разработка базируется на методе количественной ПЦР - молекулярно-генетическом подходе, позволяющем выявлять в биологическом материале специфические участки ДНК или РНК возбудителей.
В список потенциальных мишеней входят такие микроорганизмы, как Aeromonas hydrophila, Flavobacterium columnare, представители рода Pseudomonas, вирус геморрагической септицемии, а также другие патогены, поражающие лососевых и осетровых рыб.
В настоящее время для определения причины заболевания необходимо проведение нескольких различных исследований. Классические диагностические методы часто включают длительные лабораторные процедуры и не всегда дают возможность выявить микроорганизмы, которые трудно культивируются, или обнаружить инфекцию на начальных этапах.
Разработанная тест-система предназначена для одновременного выявления нескольких бактериальных и вирусных патогенов в рамках одного исследования.
Целевые характеристики проекта предусматривают чувствительность более 95% на ранних стадиях заболевания и получение результата менее чем за 2 часа.
Руководитель проекта, доцент СПбГАУ Сергей Скляров, отметил: «Большинство существующих решений рассчитано на выявление отдельных возбудителей, поэтому для получения полной картины приходится проводить несколько исследований. Наша задача — объединить в одной тест-системе диагностику наиболее опасных бактериальных и вирусных инфекций. Это поможет быстрее определить причину заболевания, локализовать очаг и не допустить распространения инфекции в хозяйстве».
Предполагается внедрение данной разработки в ветеринарных лабораториях, специализированных референтных центрах и предприятиях, занимающихся аквакультурой. Она предназначена для своевременного обнаружения инфекционных заболеваний, дифференциации патологий с похожими симптомами, оценки результативности терапевтических и профилактических мер, а также для мониторинга эпизоотической ситуации.
Одним из ключевых аспектов научной работы является адаптация тест-системы к реальным условиям работы рыбоводческих предприятий.
Исследователи намерены выявить наиболее эффективные методы сбора образцов, создать комплект праймеров и зондов, а затем провести проверку и практическое внедрение технологии на предприятиях, занимающихся аквакультурой.
Патентные поиски не обнаружили никаких документов, препятствующих внедрению результатов проекта на территории России. Исследование существующих разработок также подтвердило актуальность создания универсальных комплексов, способных одновременно выявлять сразу несколько бактериальных и вирусных возбудителей.
В состав проектной команды вошли эксперты СПбГАУ в области ветеринарии, ихтиопатологии, молекулярной биологии и биоинформатики: доцент кафедры крупного животноводства СПбГУ Сергей Скляров, профессор кафедры водных биоресурсов и аквакультуры Тамара Нечаева, специалист-биоинформатик Екатерина Пономарева и профессор кафедры крупного животноводства СПбГАУ Лариса Ильина.
Данный проект осуществляется в рамках программы по развитию технологического лидерства «От идеи к продукту». Заинтересованность в реализации выразило Управление ветеринарии Ленинградской области: внедрение тест-системы способно улучшить скорость проведения ветеринарного мониторинга, обеспечить своевременное выявление инфекционных заболеваний и снизить экономические убытки предприятий рыбного хозяйства.
Указанный проект прошел в очный этап программы «От идеи к продукту»: по итогам отбора туда попала 201 команда из 1061. На встрече в Москве 10–12 сентября участники вместе с экспертами уточнили методику реализации разработки и обсудили ее применение, а далее проект рассмотрит экспертный совет программы.
Источник: СПбГАУ.