Исследователи из Ноттингемского университета собрали гаплотип-разрешенную на уровне хромосом геномную последовательность Aegilops mutica. Исследование было опубликовано в Scientific Data и вносит вклад в растущий объем исследований, направленных на защиту мирового производства пшеницы в условиях изменения климата и новых болезней растений.
Исследование проводилось под руководством доктора Сурбхи Гревал, доцента Школы биологических наук, в рамках текущей программы предварительной селекции Ноттингемского центра исследований пшеницы (WRC).
Программа разведения направлена на внедрение полезного генетического разнообразия диких видов в культивируемые сорта пшеницы. Используя специальные методы секвенирования, доктор Гревал вместе со своими коллегами из Ноттингемского университета и сотрудниками из Института Уэллкома Сэнгера и Института Эрлхэма создали высококачественную полностью аннотированную сборку генома и ценные сведения о генетической архитектуре Aegilops mutica, вида, известного своей способностью адаптироваться к сложным условиям окружающей среды.
«Эта сборка генома высокого разрешения представляет собой значительный шаг вперед в нашей способности использовать диких сородичей для улучшения пшеницы. Благодаря таким признакам, как устойчивость к ржавчине пшеницы, как было продемонстрировано в наших прошлых исследованиях, присутствующим у Aegilops mutica, этот ресурс открывает новые возможности для повышения устойчивости современной пшеницы», - говорит доктор Сурбхи Гревал, доцент Школы биологических наук.
Более десяти лет Ноттингемский центр исследований пшеницы разрабатывает интрогрессивные линии пшеницы-Aegilops mutica, стремясь перенести полезные черты этого дикого вида в культурную пшеницу. Эти усилия заложили основу для выявления и интеграции нового генетического разнообразия в программы селекции пшеницы.
В исследовании используются молекулярные маркеры, специфичные для хромосом пшеницы, и передовые геномные инструменты для отслеживания интрогрессий от диких родственников в селекционные линии, с особым акцентом на признаках, которые повышают устойчивость к стрессу и болезням. Недавно собранный геном значительно улучшит идентификацию этих полезных признаков, позволяя селекционерам пшеницы переносить их в свой элитный селекционный материал и эффективно отслеживать полезные интрогрессии.
В прошлом году, также в журнале Scientific Data, группа опубликовала сборку генома Triticum timopheevii, пшеницы Тимофеева, еще одного дикого родственника пшеницы, что еще больше расширило геномные ресурсы, доступные для пшеницы.
Источник: University of Nottingham.
Заглавное фото: Лукьянов Дмитрий, AgroXXI.ru.
